Parte Artistica della Basilica Inferiore

Cappella di San Martino di Tours

È stata decorata da Simone Martini ed è in stile gotico.
La vita del Santo è ampiamente rappresentata dall'artista senese.
 

S. Martino dona il mantello al povero

 
San Martino a cavallo dopo essersi tolto il mantello ne fa due pezzi con la spada e ne dona una metà al povero.

S. Martino abbandona la cavalleria

Morte di San Martino

 
Il Santo è a letto contornato dagli Angeli: gli appare il Cristo.

Vi sono: la Cappella di Santo Stefano, la Cappella di S. Pietro d'Alcantara, la Cappella di S. Antonio da Padova, la Cappella di S. Stanislao.

Cappella della Maddalena

Giotto e suoi discepoli hanno qui evidenziato le principali scene di Santa Maria Maddalena.
 

Presbitero

 
Noli me Tangere

La Maddalena è protesa verso il Cristo Risorto.
 

Il Transetto

Al centro primeggia l'altare maggiore (è opera di maestri cosmateschi con 20 colonnine gotiche, con capitelli e archetti decorati a mosaico; la mensa dell'altare è formata da un'unica lastra di marmo (m 3,80 x 1,80))
 

Vele

Le volte a crociera fanno da cornice ad uno dei cicli pittorici più importanti del complesso.
Ne derivano le splendide Allegorie che per il colore, i movimenti e le espressioni dei personaggi sono di estrema suggestione

Di anonimo Giottesco non meglio identificato che con il nome di Maestro delle Vele, si narrano le virtù che San Francesco aveva a lungo predicato:
 

Allegoria della Povertà (immagine)

La Povert&agrve è su una roccia, calpesta i rovi ed è malvestita. Cristo le prende il braccio e lo porge a Francesco che infila un anello al dito della figura femminile. Sono le nozze di Francesco con Madonna Povertà, nozze a cui partecipa il Cristo stesso. Fanno da contorno gli Angeli e sulla destra (le prime due figure dopo la Povertà) sono la Speranza e la Carità. Ma non tutti sono contenti di ciò che accade; un ragazzo sta per lanciare un sasso, un altro continua a rinfoltire i rovi. Le ultime tre figure a destra simboleggiano la Superbia, l'Invidia e l'Avarizia.

Allegoria della castità (immagine)

Essa ha le sembianze di una giovane posta in un'alta torre del castello costruito sulla sommità della roccia. Prega a mani giunte. È contornata da due Angeli con corona e palma. Più in basso a sinistra è San Francesco che favorisce l'avvicinamento alla castità a tre personaggi. Sono Fra Giovanni da Muro, Santa Chiara e Dante Alighieri. Nel mezzo sono due Angeli che aiutano la purificazione. A destra invece è la penitenza incappucciata che spinge nel baratro i nemici della castità.

Allegoria dell'obbedienza (immagine)

Troneggia all'interno di un loggiato. In ginocchio, davanti alla mitica figura alata che impone silenzio, è un frate. Alla sinistra è la Prudenza e alla destra è l'Umiltà. L'orgoglio (centauro sulla destra) ha in questa rappresentazione vita difficile. Sulla tettoia del loggiato è San Francesco.

Il Trionfo di San Francesco (immagine)

Nell'ultima Allegoria, quella verso l'abside è il Trionfo di San Francesco. Il Santo è in trono e sorregge il libro e la croce. È il simbolo del vincitore attorniato da Angeli gaudenti.

Altare e Abside 

Di pregevole fattura esso contiene, nella parte che guarda l'abside, una colonnina scanalata che contiene una costola di San Giovanni Battista.
Nelle volte dell'abside è un affresco di Cesare Sermei raffigurante il Giudizio Universale.

Il coro ligneo è del 1471, opera di Apollonio Petrocchi.

Parete destra del transetto

Strage degli Innocenti

La Nascita di Gesù

Fuga in Egitto
 

Lavanda dei Piedi

Entrata di Gesù in Gerusalemme

Bacio di Giuda
 

La Crocifissione

Ai piedi del Signore c'è anche San Francesco. 
  • Cimabue

Madonna con Bambino

Siede su un trono ed è attorniata da Angeli.
  • Maestro di S. Francesco (XIII secolo).
Predica agli Uccelli 

San Francesco

Santa Chiara
È stata recentemente aperta al pubblico la Cappella delle reliquie di San Francesco ove sono conservati alcuni oggetti del Santo tra i quali una veste bianca usata nella malattia, la tonaca e i sandali, il cappuccio, un pezzetto di pelle per la ferita del costato, la benedizione autografa a Frate Leone e la bolla della Regola Francescana.

Parete sinistra del transetto

La Deposizione del Cristo

La Resurrezione del Cristo

L'Ultima Cena
 

La Salita al Calvario

La Grande Crocifissione
La Madonna dei Tramonti
  
 
Accanto alla Madonna con il Bambino, sono San Francesco e San Giovanni.

È detta Madonna dei tramonti perchè in questa parte della giornata si carica di bellissimi colori. Enigmatico segno del pollice alzato della Madonna verso Francesco.